Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms