Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Erich3F6QRE9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Erich3F6QRE9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms