Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms