Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc74aE9Q9U8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms