Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC030500E9Q6W0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms