Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ythdc1E9Q5K9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ythdc1E9Q5K9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms