Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms