Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms