Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap46E9Q2C0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms