Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms