Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3250E9Q1M3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3250E9Q1M3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3250E9Q1M3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3250E9Q1M3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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