Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms