Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo5cE9Q1F5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms