Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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