Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms