Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms