Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms