Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms