Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptbn4E9PX29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn4E9PX29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptbn4E9PX29 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms