Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3002E9PW72 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms