Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgaE9PV24 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms