Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh8D3Z6W3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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