Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms