Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5934D3Z4U6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms