Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms