Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc8D3YZV8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms