Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms