Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms