Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3259D3YUK0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3259D3YUK0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3259D3YUK0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm3259D3YUK0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3259D3YUK0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3259D3YUK0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3259D3YUK0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3259D3YUK0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm3259D3YUK0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm3259D3YUK0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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