Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm17333C6EQI3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm17333C6EQI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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