Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smok3bC0HKC9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms