Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mterf1bB9EJ57 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms