Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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