Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26c1B2RXA7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms