Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms