Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms