Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms