Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms