Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms