Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skint4A7TZF3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Skint4A7TZF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms