Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf2A3KGV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms