Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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