Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga8A2ARA8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms