Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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