Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms