Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pramef6A2A8M8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pramef6A2A8M8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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