Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms