Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo47A2A6H3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo47A2A6H3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms