Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms