Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms